Το Π.Μ.Σ. λειτουργεί µε τα διοικητικά όργανα που προβλέπει ο νόμος 4485/2017 (άρθρα 31,44 & 45), και είναι:
- Η Συνέλευση του Τµήµατος Διοίκησης Οργανισμών, Μάρκετινγκ και Τουρισμού, η οποία απαρτίζεται από τον πρόεδρο και τα µέλη ΔΕΠ της Συνέλευσης του Τµήµατος.
- Η Συντονιστική Επιτροπή (ΣΕ) του ιδίου του Π.Μ.Σ., η οποία απαρτίζεται από πέντε µέλη και συγκροτείται από το διευθυντή, τον αναπληρωτή διευθυντή και από τρία ακόμη µέλη της συνέλευσης.
- Ο Διευθυντής του Π.Μ.Σ., ο οποίος προεδρεύει της ΣΕ και ορίζεται µε απόφαση της συνέλευσης του Τμήματος.